Butter in einem Topf schmelzen. Mehl dazugeben und anschwitzen. Milch unter Rühren nach und nach dazugießen und aufkochen, bis die Sauce andickt. Ziegenfrischkäse einrühren und Béchamelsauce mit Salz, Pfeffer und Muskatnuss würzen. Sauce bei niedriger Hitze ca. 5 Minuten köcheln lassen.
Spinat waschen. Zwiebel und Knoblauch abziehen, fein würfeln und in erhitztem Öl ca. 2–3 Minuten andünsten. Spinat nach und nach dazugeben, zusammenfallen lassen und mit Salz, Pfeffer und Thymian abschmecken.
Etwas Béchamelsauce in eine Auflaufform (ca. 20 x 20 cm) geben und Sauce abwechselnd mit Spinatmischung und Lasagneplatten übereinanderschichten, dabei mit Sauce abschließen. Lasagne mit Mozzarella bestreuen und im vorgeheizten Backofen bei 200 °C (Umluft: 180 °C) ca. 20 Minuten garen. Ziegenkäse-Spinat-Lasagne mit Walnüssen bestreuen, ca. 5 Minuten goldbraun fertig garen und servieren.